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中外科学家联合完成谷子基因组测序
责任编辑:本站编辑 来源:农药工业网 日期:2012-06-04

    上周,由深圳华大基因研究院,张家口市农业科学院,丹麦哥本哈根大学的研究人员合作完成的谷子基因组研究成果于国际著名杂志《自然-生物技术》上在线发表。
 
    谷子是重要的禾本科作物之一,是目前种植第二广泛的粟类物种,其脱壳前被称为谷子,脱壳后被称为小米,是中国古代最重要的粮食作物,被称为“五谷之首”,从南到北均曾被广泛种植。
 
    该研究最新完成了一种中国国内北部谷子(foxtail millet,学名Setaria italica)品系张谷的全基因组测序,通过基因组注释和分析发现,谷子基因组中的重复序列约占整个基因组的46%,大约含有38801个蛋白质编码基因。谷子基因组序列的绘制完成,有利于分析作物数量性状位点,在这项研究中,研究人员就利用谷子基因组帮助鉴定了抗除草剂基因,并且精确识别出了抗稀禾定性状相关的基因,印证了之前研究表明的一个单核苷酸突变位点(SNP)可能是导致植株对稀禾定敏感性发生改变的结论。
 
    本研究对进一步揭示重要禾本科作物的保守性及差异性,阐明禾本科作物的基因组进化过程,进一步挖掘作物重要性状功能基因具有重要意义。同时,为提高谷类粮食遗传性状提供了宝贵的资源,为揭示谷子抗旱节水、丰产、耐瘠和高光合作用效率等生理机制的研究提供了新的途径,并为高产优质、抗逆谷子新品种的培育奠定了坚实的基础。

 

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