1. 选用无病种子 从无病田选留种子，若种子混有菌核，可用过筛法筛除菌核。

2. 加强耕作管理 避免连作，与水稻轮作1年即可减少大量存活的菌核；收获后或播种前认真清园，翻晒土壤，提高和整平畦面以利排水降湿；及时清除早期发现的病株，施适量石灰后再补苗；勿偏施、重施速效氮肥，适当增施磷钾肥。

3. 药剂防治 在菌核病发生较重的菜区，除做好上述措施外，苗期要及早喷药预防。可选喷下列药剂：（1）50%速克灵可湿性粉剂1500倍液。（2）40%纹枯利可湿性粉剂1000倍液。（3）40%菌核净可湿性粉剂1000倍液。（4）50%多菌灵可湿性粉剂600~800倍液。（5）70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液。隔7~10天喷一次，喷1~2次。