1、棉花红腐病
    在棉苗未出土前受害。幼芽变棕褐色腐烂死亡；幼苗受害，幼茎基部和幼根肥肿变粗，最初呈黄褐色，后产生短条棕褐色病斑，或全根变褐腐烂。在苗期阴雨连绵，棉苗根病初发时，及时用多菌灵（或甲基托布津、或三唑酮），隔1周喷1次，共喷2-3次
2、棉花红粉病
     整个铃壳表生松散的桔红色绒状，比红腐病的霉层厚，病铃不能开裂，僵瓣上也长有红色霉粉。可喷多菌灵、或甲基托布津、或百菌清或、代森锌等。
3、棉花炭疽病
     棉籽和幼芽受害，变褐腐烂，子叶受害后，叶缘产生褐色半圆形病斑，病斑边缘紫红色，棉苗枯萎而死。在苗期阴雨连绵，棉苗根病初发时，及时用多菌灵、代森锌或三唑酮，隔1周喷1次，共喷2-3次。
4、棉花枯萎病
症状:病株一般不矮缩，多由下部叶片先出现病状，向上部发展，病叶叶缘和叶脉间的叶肉发生不规则的淡黄色或紫红色的斑块。
（1）棉花枯萎病，用治萎灵在初发期和高峰期分别灌根1次。
（2）棉花立枯病，在苗期阴雨连绵，棉苗根病初发时，及时用多菌灵、代森锌或甲基托布津或三唑酮，隔1周喷1次，共喷2-3次。
（3）棉花角斑病，7、8月份的铃期雨量较大，尤遭暴风雨侵袭时，角斑病易流行。在发病初期防治，喷洒波尔多液、叶枯唑可湿性粉剂，或代森锌。
（4）棉花黑星病，在烂铃病原较复杂的棉区，可喷洒多菌灵、或甲基托布津、或百菌清、或代森锌等；为提高防治效果，可用波尔多液或铜皂液加入上述药剂混合施用。