沼气发酵原料经过沼气池的厌氧发酵，不仅含有极其丰富的多种营养元素和微生物代谢产物，而且含有提高植物抗逆性的激素、抗菌素等，因此，沼液不仅可以用来防治植物病虫害而且还能提高植物抗逆性。
用沼液防治不同的病害，而且生产出的农产品无农药残留，生产过程中不会污染周边环境。其用量以及配合的药剂也有所不同，需区别对待。这里介绍用沼液防治果树蚜虫、红蜘蛛和小麦赤霉病、西瓜枯萎病等几个实例，供农民朋友们参考。
1、防治蚜虫：果树和蔬菜出现蚜虫时，可用沼液进行防治。具体的方法是：用沼液14千克，10%的洗衣粉溶液0.5千克，配制成沼液复方治虫剂，用喷雾器喷施。喷施时间最好选择在晴天的上午进行。每亩田一次喷施35千克，第二天再喷施一次。生产实践表明，用产气好的沼液来防治果树和蔬菜蚜虫，喷施一次，防治率为70%左右，喷施两次可达96%以上。
2、防治果树红蜘蛛：在苹果、柑橘等果树的生长期间，用沼液原液或加少量农药喷施果树可防治果树红、黄蜘蛛等病虫害。沼液浓度越高杀虫效果越好，用沼液喷施果树时加入吡虫啉或灭扫利等农药，杀虫杀卵效果非常显著，而且药效能持续30天以上。
3、沼液防治小麦赤霉病：赤霉病是小麦生产中的主要病害之一，发病率高，流行面积大。正常发酵产气沼气池中的沼液对小麦赤霉病有明显的防治效果，它的作用和生产上所用的多菌灵效果相当；使用沼液原液喷施，效果最佳，使用量通常是每亩喷50～100千克，在盛花期喷一次，隔3～5天再喷一次，防治率能够达到80%。
4、沼液防治西瓜枯萎病：西瓜枯萎病是西瓜生产的大敌。在西瓜生产中，可以用20倍沼液浸种8小时，并在生长期叶面喷施10～20倍沼液3～4次，基本上可以控制枯萎病的大面积发生。在西瓜膨大期，结合叶面喷施沼液，用沼渣进行追肥，不但枯萎病得到控制，而且能获得较高的产量，西瓜品质也有所提高。
此外，沼液对棉花的枯萎病和炭疽病菌、马铃薯枯萎病、小麦根腐病、水稻小球菌核病和纹枯病、玉米的大小斑病菌以及果树根腐病菌也有较强的抑制和灭杀作用。