苦瓜常发病有线虫病、枯萎病（嫁接苗一般不发病）、白粉病、疫病、炭疽病等。虫害主要为瓜实蝇、蚜虫。

    白粉病：在开花结瓜期间发病，在叶片上布满白色粉状物，使叶片失绿黄化，造成植株早衰。防治方法：当叶片上有白色粉状物出现时，应每7-10天叶面喷洒一次氰菌唑水溶液、粉锈宁水溶液、翠贝、或硫悬浮剂水溶液进行防治，连续喷洒2-3次，注意药水水量一定要大。
　　疫病：在叶片上多从叶尖或叶缘开始，病斑形状不规则，周缘不明显，初呈暗绿色，水渍状，后变褐色。病斑可扩大至整个或大半个叶片，潮湿时，在病斑交界处，长出一圈白色霉状物。防治药剂：百菌清、疫克、波耳多液、农利灵、安克、西先吗啉、乙磷铝、杀毒矾或金雷多米尔喷施，病叶摘除带走销毁。
　　螟虫：用三唑磷、杀虫单、杀虫双、锐劲特、毒死蜱、Bt喷杀。
　　蚜虫：吡虫啉、啶虫脒、阿维菌素喷杀。
　　瓜实蝇：以幼虫蛀入幼瓜为害，使幼瓜畸形，并提前转色，其后腐烂变质，还散发恶臭气味。防治方法：在幼瓜期，用锐劲特水溶液，或农地乐水溶液，或功夫水溶液喷洒幼瓜2-3次，每4-5天一次，并及时摘除畸形果，集中园外烧毁或深埋。