随着大豆种植年限的延长，不合理轮作及使用不安全的苗前除草剂，大豆根腐病的发生有加重趋势。低温及低洼地、连续降雨、根部易发病。播种过深、过早、幼苗出土慢，重茬、耕作粗放地块发病重。
1.大豆根腐病为什么难防治？
一是大豆根腐病菌的病原菌种类多，已知的有10多种，有镰孢菌属（尖孢镰孢菌、禾谷镰孢菌、茄腐镰孢菌、燕麦镰孢菌）、丝核菌属（立枯丝核菌）、腐霉菌属（终极腐霉菌）、紫青霉菌、褐秆病等。二是不合理轮作，特别是有的连续多年重茬，田间大豆根腐病原菌量多。三是使用不安全的苗前除草剂。四是多年连续使用多克福种衣剂，大豆根腐病病原菌生理小种发生变化，大豆根腐病病原菌对常用种衣剂多克福产生了抗性。五是常用35%多克福种衣剂有效期短，对褐秆病无效。六是30%以下的多克福种衣剂及仅含有杀虫剂的种衣剂对大豆安全性差，药效差或无药效。
2.如何选择大豆种衣剂？
（1）选择大豆种衣剂首先看安全性。多克福种衣剂合有克百威，克百威做成3%颗粒剂与大豆分箱播种对大豆是安全的；种衣剂加入克百威在低温条件下克百威对大豆不安全，常造成药害，表现大豆子叶褐色，根畸形，抑制根的生长。35%多克福种衣剂比30%以下多克福种衣剂安全，含有机磷类杀菌剂的种衣剂如甲基异柳磷、甲拌磷、乐果等更不安全。最安全的种衣剂是2.5%适乐时、35%金阿普隆悬浮种衣剂。
（2）选择大豆种衣剂要看防治效果
二十世纪八十年代科技成果防治大豆根腐病有效药剂是多菌灵＋福美双，九十年代投入市场35%多克福种衣剂、卫福（萎锈灵＋福美双）种衣剂是当时防治大豆根腐病最好的种衣剂，近年来新上市的2.5%适乐时＋35%金阿普隆防治大豆根腐病药效好，杀菌范围更广，对褐秆病有效。
（3）选择大豆种衣剂要看有效期
大豆根腐病发生时间长，对种衣剂的要求最好有60天以上的有效期。二十世纪九十年代推出的多克福、卫福种衣剂仅有25天左右的有效期，只能做到保主根、包幼苗、推迟侵染、减轻危害。九十年代中期八一农大将多克福种衣剂加入益微（增产菌）防治大豆根腐病有效期延长到50～60天。新上市的2.5%适乐时＋35%金阿普隆防治大豆根腐病有效期可达70天以上，是目前有效期最长的大豆种衣剂，近几年上市的其他种衣剂有效期均在25天左右。
（4）根据病原菌种类选择种衣剂
大豆根腐病多种病原菌常混合发生。镰孢菌适宜发病的土壤条件为PH值5～6.5的酸性、弱酸性土壤；立枯丝核菌、腐霉菌、褐秆病菌适宜发病的土壤条件为PH6.5～7的微酸性土壤。2.5%适乐时悬浮种衣剂对镰孢菌、立枯丝核菌有效，35%金阿普隆对腐霉菌、褐秆病有效，2.5%适乐时悬浮种衣剂＋35%金阿普隆悬浮种衣剂对镰孢菌、立枯丝核菌、腐霉菌、褐秆病有效，是完美的配方；35%多克福、卫福等种衣剂对镰孢菌、立枯丝核、菌腐霉菌有效，对褐秆病无效。
紫青霉菌可产生对大豆有害的毒素，是大豆造成减产，目前对紫青霉菌是生物制剂埃坶泌（一种放线菌），同时对镰孢菌有效。
3.防治大豆根腐病最好技术
（1）合理轮作
（2）选择好种衣剂
①埃坶泌颗粒剂3～5公斤/亩与大豆种子混播。
②选择大豆种衣剂从安全性、药效、有效期和防治病原菌种类综合考虑，2.5%适乐时＋35%金阿普隆种衣剂是最佳选择，其次是35%多克福种衣剂、卫福、菌克毒克种衣剂＋益微混用。
在pH值5～6.5的土壤选用2.5%适乐时悬浮种衣剂150～200毫升/100公斤大豆种＋益微100～150毫升（克）＋水600～900毫升。
在pH值大于6.5的土壤选用2.5%适乐时悬浮种衣剂＋35%金阿普隆悬浮种衣剂混用，2.5%适乐时悬浮种衣剂150～200毫升＋35%金阿普隆悬浮种衣剂20毫升/100公斤大豆种子＋益微100～150毫升（克）＋水600～900毫升。
在种子含水量低，大机械包衣和温度较高条件下用低水量；在种子含水量稍高，手工或小大机械包衣和温度较低条件下用高水量，总的原则大豆拌种衣剂不要超过种子量的1%，加水过多会使种皮膨胀，脱落，影响大豆发芽率。
4.哪些大豆种衣剂不能用？
①配比不合理、对大豆安全性差的种衣剂如30%多克福种衣剂。
②低含量的大豆种衣剂如25%多克福种衣剂或含量更低的种衣剂，原因是配比不合理，有的杀虫剂含量过高，无杀菌剂或杀菌剂太少，安全性差，用量大、用水量必然要大，大豆种皮膨胀，易破损影响大豆发芽。
③未注册登记、假劣种衣剂不能用。
④使用技术不成熟的不能用。
⑤仅含微量元素、人工合成的植物生长调节剂等种衣剂不能用。
⑥有机磷类杀虫剂如甲拌磷、甲基硫环磷、甲基异柳磷、乐果等对大豆安全性差、对大豆潜根蝇等地下害虫有效期短，药效差，不能防治大豆孢囊线虫。