袋栽香菇易发生污染，与原材料、菌种、塑料袋的优劣、生产和管理粗放、长期应用纯化学药品消毒防效单一、杂菌产生了抗农药性等方面有关。下列方法可有效解决污染问题。

    一、培养基的配制

    培养基拌料时应按防污剂的用量比保持同一用量或浓度，一次或分次溶于拌料的水中，充分溶解搅混均匀后施入拌均匀的干培养料中，用铁锨反复使劲拍拌培养料，让防污剂充分浸入培养料中，达到均匀后，即可装袋。

    二、装袋、灭菌

    装料应选用0.04毫米以上韧性强、簿厚均匀、不易脆裂、无破漏的优质聚乙烯或聚丙烯塑料袋(筒)。制种时应把料装得松紧适度，栽培时适当把料装紧实，装至袋口6-10厘米左右按平料面，用塑料扎绳扎紧袋口或按常规方法封口后即可灭菌。一般温度达100℃维持4-8小时(小袋4-5小时，大袋6-8小时) 左右。如塑料袋较大装料较多，可适当延长灭菌时间2-4小时。灭菌后取出培养料袋放入接种室降温至25℃或冷却后，用1.5%的防污剂对接种室均匀喷雾消毒(也可按常规方法消毒)，20分钟后即可进行接种。

    三、接种、培养

    接种应选用抗逆性强、出菇和转潮较快、生长周期较短、高产优质、无污染健壮菌种，以缩短生长期，减少病虫危害。接种时，可采用一端或两端接种等方式，把菌种挖取成块状，适当增加接种量，促进菌丝较快地生长，缩短发菌期，提高栽培产、质量。接种后移入培养室进行培养。培养应选用保温、通风、降温等条件较好的室内作培养室。使用前用防虫、消毒剂进行处理后，将接种的培养料袋移入竖直或横码于室内的培养架上，温度保持在20℃-25℃左右。培养10天左右应翻袋检查成活及有无污染。如有未成活和污染的培养料袋应拣出培养室，并查找原因，采取补救措施(挖去未成活和污染菌种，消毒后补接种)。在培养期间应做好保温保湿、降温、翻袋换位、消毒和防虫等工作。当菌丝满袋后再培养一段时间，菌丝体稍收缩变紧实，即可作菌种，或进行出菇管理。