氟虫双酰胺和氯虫苯甲酰胺杀虫剂作用机理相同，防治目标均为鳞翅目害虫，但二者仍存在以下区别：

（1）结构不同。氟虫双酰胺为双酰胺共轭结构，含氟原子；氯虫苯甲酰胺为单酰胺结构，含Cl和Br原子。前者属于二酰胺类化合物，后者不仅属于二酰胺类化合物，也属于吡唑类化合物。

                               氟虫双酰胺                               氯虫苯甲酰胺

    尽管氟虫双酰胺具有双酰胺共轭结构和氟原子，但大田表现并没有超越氯虫苯甲酰胺，原因可能在于氯虫苯甲酰胺的吡唑活性结构。在示范试验中可发现氟虫双酰胺起效速度快于氯虫苯甲酰胺，即前者施用后，害虫1-2个小时停止活动，后者则需要3-4个小时；死虫高峰期，前者大约在3-5天左右，后者一般在5-7天左右。起效速度的差异也可归因于结构上的差异。

（2）剂型不同。氟虫双酰胺成品采用水分散粒剂，崩解速度快，分散均匀；氯虫苯甲酰胺在水稻上登记的成品采用悬浮剂，与水分散粒剂性比，容易粘袋，造成浪费，溶解性能没有水分散粒剂好。水分散粒剂是比悬浮剂更环保的剂型，技术上更先进。

（3）传导性差异。严格意义上，氟虫双酰胺和氯虫苯甲酰胺都不具有内吸性，尽管它们都可以通过作物的木质部进行传导。但二者具有强渗透作用，通过叶片施用后，可进行短距离的传导，同叶传导较好，但跨叶传导很差。试验表明，从根部施用，氯虫苯甲酰胺比氟虫双酰胺表现出更好的木质部传导性能。

（4）稻纵卷叶螟敏感性不同。稻纵卷叶螟对氟虫双酰胺极度敏感，稀释10000倍的药效仍要高于3000倍的氯虫苯甲酰胺。

（5）温度敏感性不同。试验发现，氯虫苯甲酰胺在持续低温和高温天气下，药效有减弱现象；氟虫双酰胺则对温度敏感性低，持续低温和高温对其药效影响不明显。