从2006年以来，拜耳作物科学遭美国约1.1万农民的起诉，起诉其转基因水稻污染到其他水稻品种并影响到出口品质。最终，拜耳作物科学败诉，将支付原告7.5亿美元赔款。

    2006年8月，拜耳作物科学与路易斯安那大学曾对水稻品种进行测试，在学校克罗利的一处实验田中培育抗Liberty除草剂品种，造成了转基因品种在长粒水稻中的痕量残留，污染范围超过美国水稻种植面积的30%。污染的新闻一出，四天内，使水稻价格走低了14%，并且，使水稻出口至欧盟、日本、俄罗斯及其他国家受阻，订单暂停或者推迟，损失了约1.5亿的种植成本。
 
    2006年-2009年间，来自美国德克萨斯州等五个州的约1.1万农民起诉拜耳作物，要求其必须采取措施并为美国水稻种植户的损失负责，索赔金额高达7.5亿美元。此次诉讼原告占到美国长粒水稻种植者的至少85%，经过长期的诉讼，原告终于得以胜诉。

    拜耳作物科学已经表示接受了赔款判决。其发言人表示，虽然拜耳作物自信在处理转基因水稻时慎之又慎，但为了使公司能贯彻专注于为现代农业提供创新解决方案的宗旨，公司认为合理解决此次诉讼更为重要。